CEPRODE esta afiliado a 14 grupos de trabajo, de los cuales 10 corresponden al ámbito nacional y 4 al internacional, según el siguiente detalle:

a) Nivel local
a1) Corporación de Organizaciones Ambientalistas de El Salvador (CoAMBIENTE)
a2) Red Nacional de Información Documental en Salud (RENIDS)
a3) Comité interinstitucional para el desarrollo del cantón Las Piedras, Metapán Santa Ana (CIDECAP)
a4) Comité Ambiental del departamento de Chalatenango (CACH)
a5) Comité Ambiental del departamento de Santa Ana
a6) Comité Salvadoreño de la Unión Mundial de la Naturaleza (UICN)
a7) Comité Pro Medio Ambiente de Metapán (COPROMA)
a8) Red Nacional de Organizaciones con trabajo hacia la equidad de género (REDNA)
a9) Comité Coordinador del Programa de Agricultura Sostenible (PASOLAC)
a10) Unidad Ambiental de La Palma

b) Nivel Internacional
b1) Nitrogen Fixing Tree Asociation (NFTA), Hawaii, USA
b2) Foro Global de Prevención de Desastres, Haryana, India
b3) Unión Mundial para la Naturaleza (UICN), Suiza.
B4) Fundacrid, Costa Rica.